Iako je botoks prvenstveno popularan za estetske i anti-age tretmane, često se upotrebljava u stomatološkoj praksi u liječenju brojnih oralnih stanja. Botoks se može primjenjivati za liječenje bruksizma i temporomandibularnih poremećaja. Aplikacijom u mišić masseter, smanjuje se stiskanje i škripanje zubi što dovodi do značajnog ublažavanja bola i poboljšane funkcije čeljusti. Botoks također ima primjenu u oralnoj i maksilofacijalnoj kirurgiji pri prijelomima te ublažava napetost u hiperaktivnim mišićima tijekom parodontnih regenerativnih postupaka.
Botoks se može koristiti za smanjenje pojave prekomjerne vidljivosti gingive (gummy smile) jer opušta mišiće gornje usne. Sa širokom terapijskom i estetskom primjenom, botoks nudi vrijedan dodatak stomatološkoj skrbi.